系所簡介
一、設立宗旨
地球人口的增長並未趨緩，學者預估將在 2050年挑戰百億大關，在可耕地受限與環保意識抬頭的當下，如何在環境永續的前提下提高糧食生產是 21 世紀的重要課題，即新綠色革命的開展。過去台灣對熱帶農業資源的過度開發導致嚴重的生態問題，如何促成永續農業的轉型是台灣農業的重點課題，而「轉譯農學」與「土壤微生物」正是環境永續的關鍵技術。植物分子生物學的發展獲得許多植物生理數據，但轉譯到糧作改良仍顯停滯，因為許多農業應用的性狀是由多基因與環境因素等多重的影響所調控，例如產量和逆境耐受性等，因此基因體學的應用研究成為轉譯農學突破的關鍵之一。另一方面，慣行農業大量仰賴肥料與農藥的化學輸入，因而造成土壤劣化與環境汙染。土壤微生物與植物生長密切相關，健全的根際微生物相能減少化學肥料與農藥的使用，達成農業發展、生態健康、人民幸福的完美平衡。。學理上研究植微交互作用，並開發農業微生物之應用，乃實踐永續農法的依據，亦為台灣農業未來努力的目標。
成功大學自 2008年起設立本 「熱帶植物科學研究所」，期以解決本土農業問題為己任，；近年鑑於植物與環境之關係密不可分，微生物更在植物生理與土壤健康上扮演舉足輕重的角色，本所自108學年度更名為「熱帶植物與微生物科學研究所」，以更符合植物科學研究與永續農業的重心。研究重點囊括兩大部分：(1)植物功能性機制及(2)微生物與植物、環境互動機制，放眼國際上重要農業議題。這些研究成果將回饋給在地農民發展永續農業，讓社會責任的實踐肩負在本所發展目標中。
二、教育目標
1. 培育具整體性探討熱帶植物與微生物科學之研發人才。
2. 孕育具國際視野並主動關懷植物相關本土產業領域的現代公民。
三、研究特色
1. 開展糧食與經濟作物之生物技術，並開發智慧農業之植物生物技術。
2. 整合植物與微生物基因體學與生物資訊學，加強其應用並開發生物資訊工具。
3. 進行熱帶植物之逆境生物學研究，結合土壤微生物應用，發展永續農業。
四、核心能力
1. 具備植物與微生物科學專業知識及實務技能。
2. 擁有獨立思考與判斷的能力。
3. 展現跨領域學習與創新能力。
4.實踐團體合作與溝通解決問題的能力。
五、基本素養
1. 培養具人文與科學思考邏輯之熱帶植物與微生物科學與技術人才。
2. 掌握國際植物與微生物科學與技術研究方向與發展。
3. 積極主動關懷農業與糧食之相關社會議題。
4.具備轉譯基因體學的創新應用能力。